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BOTTIN

Plate-forme de Génomique, protéomique et bio-informatique

La plateforme de génomique, protéomique et bio-informatique du CRCHUQ, développée en partie à l’aide de subventions de la FCI, est localisée aux sites CHUL et L’HDQ. La majeure partie sera regroupée en 2009 au «Centre de génomique humaine et microbienne de Québec (CGHM)». La section de protéomique effectue plus de 2000 analyses par année, pour plus de 125 chercheurs et la section de séquençage et de génotypage dessert 200 chercheurs avec plus de 150 000 séquences par année. La section de micropuces a analysé plus de 10 000 échantillons d’ARN provenant de plus de 75 projets en génomique. En plus d’avoir contribué à la formation de très nombreux étudiants gradués et de stagiaires postdoctoraux, les résultats découlant de l’utilisation de ces plates formes furent publiés dans plus 300 articles scientifiques. Le site HDQ héberge le FRSQ-Réseau Cancer Core Genomic Facility (RCCGF). Il s’agit d’un service d’analyse de l’expression génique utilisant la plate forme Agilent Technologies. Cette composante de la plate-forme offre également des services de préparation et d’impression de micropuces personnalisées. La section de bio-informatique a développé des systèmes de gestion de l’information de laboratoire, une base de données intégrée et un système web pour la gestion et le stockage de données ainsi que l’expertise pour l’analyse des données générées par les séquenceurs de nouvelle génération.

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